***** دكتر سيد اصغر هواي ي دانشيار گروه ميكروبشناسي دانشكده پزشكي دانشگاه علوم پزشكي اصفهان اصفهان ايران.

Transcript

1 س( مقاله پژهشي مجله دانشكده پزشكي اصفهان سال بيست هفتم/شماره 93 /ارديبهشت 1388 بررسي فرااني نسبي ژنتيپهاي مختلفA vacدر هليكباكترپيلري جدا شده از بيپسي هاي معده بيماران مبتلا به آدنكارسينما زخم اثني عشر گاستريت مراجعه كننده به بيمارستانالزهرا(س) شهر اصفهان بهرشPCR ** * دكتر سيد اصغر هاي ي دكتر رسل صالحي دكتر سيد ع يل ***** **** تكلي دكتر پريز مهاجري *** فاضلي دكتر حميد * ** *** تاريخ دريافت: 87/3/4 تاريخ پذيرش: 87/5/18 دانشيار دانشيار **** مقدمه: رشها: يافتهها: نتيجهگيري: اژگان كليدي: تعداد صفحات: تعداد جدلها: تعداد نمدارها: تعداد منابع: آدرس نيسندة مسي ل: دانشيار گره ميكربشناسي دانشكده پزشكي دانشگاه علم پزشكي اصفهان اصفهان ايران گره سللي ملكلي دانشكده پزشكي دانشگاه علم پزشكي اصفهان اصفهان ايران گره ميكربشناسي دانشكده پزشكي دانشگاه علم پزشكي اصفهان اصفهان ايران استاديار گره داخلي فق تخصص بيماريه يا گارش كبد دانشگاه علم پزشكي اصفهان اصفهان ايران ***** استاديار گره ميكربشناسي دانشكده پزشكي دانشگاه علم پزشكي كرمانشاه كرمانشاه ايران چكيده هليكباكترپيلري ارگانيسم گرم منفي خميده شكل است كه در دستگاه گارش انسان مستقر شده باعث برز عارض مختلف دستگاه گارش از جمله زخم اثني عشر گاستريت هاي معده مثل آدنكارسينما شد. يكي از فاكترهايي كه تجه متخصصين را زياد به خد معطف كرده است امكان ارتباط ژنهاي خاصي از اين باكتري يعني caga vaca icea با علايم باليني گناگن ميباشد. در اين تحقيق فرااني ژنتيپهاي مختلف m2s2) m2s1a m1s1b1 vaca m1s1a m1s2 (m2s1b در سشهاي جدا شده از بيماران مبتلا به گاستريت زخمهاي اثني عشر آدنكارسينما ارتباط آن با بيماريهاي مذكر مرد بررسي قرار گرفته است. در مطالعهي حاضر از بيمار مبتلا به بيماريهاي مذكر در بخش آندسكپي بيمارستان الزهراي ( اصفهان بيپسي تهيه گرديد. پس از جداسازي هليكباكترپيلري انجام تستهاي بيشيميايي جد آللهاي مختلف ژن vaca تسط PCR مرد بررسي قرار گرفت. از صد بيمار باكتري هليكباكترپيلري در شرايط ميكراي رفيليك جداسازي مرد آزمايشهاي بيشيميايي قرار گرفت. از يكصد بيمار با كشت مثبت 40 نفر مبتلا به گاستريت 40 نفر زخم اثني عشر 20 نفر آدنكارسينما بدند. جد آللهاي m1s1a در بيماران مذكر داراي فرااني %25 %27/5 %35 %20 m1s1b %25 %25 %30 m2s1a %30 %30 %10 m2s1b %25 %5/7 %1 %30 بد آلل S2 نيز در هيچكدام از باكتريهاي فق مشاهده نشد. در اين مطالعه رابطهاي بين ژنتيپهاي مختلف vaca بيماريهاي مذكر ديده نشد. هليكباكترپيلري vaca آدنكارسينما زخم اثني عشر نرمال گاستريت PCR دكتر سيد اصغر هاي ي دانشيار گره ميكربشناسي دانشكده پزشكي دانشگاه علم پزشكي اصفهان اصفهان ايران. havaei@med.mui.ac.ir ٨٥ مجله دانشكده پزشكي اصفهان سال بيست هفتم / شماره 93 /ارديبهشت 1388

2 بررسي فرااني نسبي ژنتيپهاي مختلف vac A در... دكتر سيد اصغر هاي ي همكاران m2 مقدمه هليكباكترپيلري ارگانيسم گرم منفي ميكرآي رفيليك است. اين باكتري ميتاند بهطر جالبي مكس معده را براي دهها سال با جد پاسخهاي ايمني اكتسابي التهابي نيز جايگزيني پيسته (turn over) اپيتليال معده آلده نمايد (1). هليكباكترپيلري عامل مهم زخم معده است به عنان ريسك فاكتري براي ابتلاء به سرطان معده محسب ميشد (2). شيع عفنت با اين باكتري در جهان بالاست حدد %80 افراد ساله در ژاپن (3) به طر كلي نيمي از جمعيت جهان به اين باكتري آلدهاند (2). گرچه تنها در تعداد معددي از افراد فق زخم معده برز ميكند بيماريزايي هليكباكترپيلري بهطر كامل شناخته نشده است. لي فاكترها يرلانس مهم در اين باكتري يافت شده است كه به نظر ميرسد با خيم شدن زخمهاي مكس معده در رابطه باشد (3). يكي از اين فاكترهاي بيماريزايي سيتتكسين اكي لينگ است. اين تكسين قادر به القاء اكي ليشن سيتپلاسميك در اناع ردههاي سللي پستانداران در شرايط in vitro نيز تخريب سللهاي اپيتليال السراسين مكزال معدهي مش در مارد تجربي است. اين تكسين محصل بيان ژن vac A در هليكباكترپيلري است. ژن مزبر در اكثريت قريب به اتفاق سيههاي هليكباكترپيلري جد دارد لي تنها نيمي از اين سيهها قادر به القاء اكي ليشن در سللهاي اپيتليالند (4). ژنتيپهاي مختلفي از vac A شناخته (tox+) شده است. اين ژن به د ناحيه signal sequence mid region S2 تايپهاي تقسيم ميشد. ناحيهي ال داراي S1 ناحيهي دم داراي تايپهاي m1 است. هر يك از سيههاي جدا شده تنها ميتاند حاي يكي از اناع تايپهاي ناحيه ال دم باشد. به عبارت ديگر يكي از چهار حالت ممكن را ميتاند دارا باشد. البته مطالعات بيشتر نشان داده است كه ناحيه S1 داراي ساب تايپهاي S1a S1b است (3). مدارك نشان ميدهد كه تفاتهايي بين سيههاي مناطق جغرافيايي مختلف از نظر اين تايپها جد دارد (2). مطالعات فرااني در جهت يافتن رابطه بين ژنتيپها پيامد نهايي عفنت به عمل آمده كه البته برحسب مقعيت جغرافيايي متفات است (5). از جمله عارضي كه به هليكباكترپيلري ژنتيپهاي آن نسبت داده ميشد ميتان به Normal/gastritis Duodental ulcer Gastric cancer اشاره كرد (3). شناخت كامل خصصيات ژنتيكي اين باكتري رابطهي اين خصصيات ژنتيكي با عارض ايجاد شده نقطهي عطفي در ارايهي رشهاي تشخيص پيشگيري زخم معده سرطان معده خاهد بد. همانطر كه اشاره شد ژنتيپهاي اين باكتري برحسب مقعيت جغرافيايي متفات است. لذا شناخت ژنتيپهاي مجد در ايران نيز ژنتيپ غالب جهت حصل به اين هدف لازم ضرري است. طبق بررسيهاي انجام شده تاكنن در جهت تعيين ژنتيپهاي هليكباكترپيلري از نظر ژن vac A مطالعهاي در ايران حتي خارميانه صرت نگرفته است. در حالي كه در كشرهاي شرق آسيا مثل ژاپن چين سنگاپر كشرهاي ارپايي آمريكايي مطالعات كاملي در اين زمينه انجام شده است. با تجه به اين كه آژانس بينالمللي تحقيق بر ري سرطان %55 از سرطان هاي معده را به اين باكتري نسبت ميدهد (6). بدين دليل مجله دانشكده پزشكي اصفهان سال بيست هفتم / شماره 93 /ارديبهشت

3 بررسي فرااني نسبي ژنتيپهاي مختلف vac A در... دكتر سيد اصغر هاي ي همكاران (DU) (NUD) گره تقسيم شدند: بيمار مبتلا به دي دنال السر بيمار مبتلا به نرمال/گاستري بيمار مبتلا به كانسر (CA) هليكباكترپيلري را در كلاس يك كارسينژنهاي معده قرار ميدهند (7). رشها تحقيق ما از نع تصيفي تحليلي Diagostic-testing بد. جامعهي مرد مطالعه بيماران داراي ديسپپسي يا مشكك به داشتن دي دنال السر يا آدنكارسينم از نظر باليني بد كه به بخش آندسكپي بيمارستان الزهرا (س) مراجعه كردند. نمنه گيري تسط پنس مخصص از كانال آندسكپ صرت گرفت. در مرد بيماراني كه كانسر معده از نظر نماي آندسكپيك داشتند يا داراي زخم معده بدند حداقل 6 نمنه از محل تده يا حاشيهي زخم گرفته شد. بيماران مبتلا به كانسر معده پس از تا ييد پاتلژي ارد مطالعه شدند. در مرد كليهي بيماران از ناحيه incisura يا prepyloric نمنه براي كشت هليكباكترپيلري گرفته شد. در صرت گرفتاري اين ناحي تسط تدهي تمرال ناشي از كانسر معده بيپسي از ناحي ديگر معده گرفته شد معيارهاي رد به مطالعه بيماران داراي نماي باليني ضايعات زير بد: -1 كانسر :(CA) بيماران با آدنكارسينم معده كه پيشتر تحت درمان (شيميتراپي) قرار نگرفته بدند. كانسر اين افراد از طريق پاتلژي ثابت شد. 2- دي دنال السر :(DU) بيماران با السرهاي پپتيك با يك دي دنال لكليزيشن بر اساس يافته آندسكپيك. -3 نرمال/گاستريت :(NUD) بيماران با معدهي نرمال يا گاستريت مزمن نان آي رفيليك يا سپرفاشيال. رش نمنهگيري از نع آسان بد. بيماري كه داراي كشت مثبت هليكباكترپيلري بدند به سه يكي از نمنههاي بيپسي شده جهت انجام تست rapid urease test (RUT) به للههاي حاي محيط كشت اره ارد شد نتيجهي حاصل از ري تغيير رنگ محيط ثبت شد. بيپسي ديگر در شرايط استريل به سرعت به محلل نرمال سالين منتقل شد حداكثر در مدت 2 ساعت نمنه به آزمايشگاه ميكربشناسي منتقل شد. نمنه در شرايط استريل له شده بر ري محيط كشت اختصاصي هليكباكترپيلري كه حاي محيط غني مكمل (آنتيبيتيك) كشت داده شد. شرايط ميكرآي رفيليك با %10 به كمك Gaspack CO 2 براي رشد باكتري فراهم شد. جار مربط به انكباتر منتقل ساعت در دماي 35 درجه سانتيگراد انكبه شد. كشت خالص تهيه تستهاي بيشيميايي افتراقي مثل كاتالاز اكسيداز ارهاز نيز رنگآميزي گرم انجام شد. باكتريها در محيط BHI فريزر 80- درجه سانتيگراد نگهداري شدند. در ا لين مرحله به كمك كيت Pure PCR Template Preparation kit ژنم باكتري استخراج شد. ميزان خلص DNA استخراج شده به كمك اسپكترفتمتر اپندرف ميزان جذب نر در نانمتر تعيين شد. پرايمرهاي اختصاصي (جدل 1) براي ژنتيپهاي مختلف vac A يعني s1a m2 m1 s1b بهكار رفت (4). سيكل دمايي براي انجام PCR به دين منال اعمال گرديد: دماي 95 درجهي سانتيگراد به مدت 1 دقيقه دماي 52 درجهي 87 مجله دانشكده پزشكي اصفهان سال بيست هفتم / شماره 93 /ارديبهشت 1388

4 بررسي فرااني نسبي ژنتيپهاي مختلف vac A در... دكتر سيد اصغر هاي ي همكاران گرديد. بر مبناي اندازهي باندهاي ايجاد شده در مقايسه با ماركر زن ملكلي ژنتيپ سيهها از نظر vac A مرد ارزيابي قرار گرفت. سانتيگراد به مدت 1 دقيقه دماي 72 درجهي سانتيگراد به مدت 1 دقيقه براي 35 سيكل. پس از انجام PCR محصل مربط تسط آگارز ژل الكترفرز رنگآميزي با اتيديم برمايد بررسي Region amplified m1: m2: s1a: s1b: s2: جدل 1. پرايمرها آلل هاي VAC a هليكباكتر پيلري Primer designation VA3- F VA3- R VA4- F VA4- R SS1- F VA1-R SS3-F VA1-R SS2- F VA1-R Primer sequence 5' GGTCAAAATGCGGTCATGG 3' 5' CCATTGGTACCTGTAGAAAC 3' 5' GGAGCCCCAGGAAACATTG 3' 5' CATAACTAGCGCCTTGCAC 3' 5' GTCAGCATCACACCGCAAC 3' 5' CTGCTTGAATGCGCCAAAC 3' 5' AGCGCCATACCGCAAGAG 3' 5' CTGCTTGAATGCGCCAAAC 3' 5' GCTAACACGCCAAATGATCC 3' 5' CTGCTTGAATGCGCCAAAC 3' Size and location of PCR product 290 bp 352 bp 190 bp 187 bp 199 bp يافتهها مطالعهي انجام شده بر ري سيههاي هليكباكترپيلري حاكي از آن است كه چهار ژنتيپ مختلف m1s1b m2s1a m2s1b m1s1a vac A مربط به در ميان اين باكتريها جد دارد قطعهي (گاستريت زخم اثنيعشر آدنكارسينما) نشان ميدهد. آزمن χ 2 نشان ميدهد كه بين ژنتيپهاي مختلف vac A بيماريهاي ياد شده رابطهاي جد ندارد (0/64 = P). مطالعهي ما نشان ميدهد كه ژنتيپ غالب در مرد گاستريت زخم اثني عشر m2s1a m1s1a است در حاليكه در خصص آدنكارسينما ميباشد. البته همانطركه ذكر شد اين اختلاف معنيدار نيست. s2 در هيچكدام از مارد فق مشاهده نشد. جدل شماره 2 تزيع فرااني ژنتيپهاي مختلف vac A را در سيههاي جدا شده از نمنههاي بيپسي معده مربط به بيماريهاي مختلف حالت كلي درصد تعداد درصد جدل 2. تزيع فرااني ژننيپهاي مختلف vac A در هليكباكترپيلريهاي جدا شده از نمنههاي معده آدنكارسينما تعداد درصد زخم اثنيعشر تعداد درصد / گاستريت تعداد 10 بيماريها ژنتيپها M1s1a M1s1b M2s1a M2s1b / جمع مجله دانشكده پزشكي اصفهان سال بيست هفتم / شماره 93 /ارديبهشت

5 بيماري سلياك در مبتلايان به اناع سءهاضمه رامين قهرماني همكاران بحث از زمان كشف ارتباط عارض گارشي هليكباكترپيلري بيش از د دهه نميگذرد لي در اين مدت مطالعات بسيار زيادي در اين خصص انجام گرفته است. برخي از اين مطالعات در مرد تعيين فرااني ژنتيپهاي مختلف برحسب منطقهي جغرافيايي است كه ميتاند اطلاعات مفيدي را براي تحقيقات بعدي به يژه ارايهي رشهاي پيشگيري درمان فراهم نمايد. مطالعهاي كه ما انجام داديم حاكي از آن است كه در منطقهي اصفهان ناحيهي در S2 ژنم هليكباكترپيلريها ديده نميشد در مقابل از منطقهي m2 m1 ناحي mid region s1a s1b از ناحيهي signal sequence هليكباكترپيلري مشاهده ميشد. مطالعهي انجام گرفته تسط ژنتيپهاي van Doorn m1s1b m2s1a m2s1b ژنم m1s1a فرااني را به ترتيب درصد نشان ميدهد. اين مقادير در مطالعهي ما بهترتيب درصد است كه حاكي از تفات فرااني ژنتيپهاي مختلف بر حسب منطقهي جغرافيايي است (8). مطالعهي انجام شده تسط Strobel همكاران در آلمان نيز حاكي از آن است كه %96 سيههاي جدا شده در اين كشر حاي ژن %4 حاي ژن s2 s1 %51 سيهها حاي ژن m1 ديگري كه در آلمان تسط Han هستند (9). مطالعهي همكاران انجام شد اين مقادير را %83 %16 %51 نشان داد كه نشان از شباهت د مطالعه انجام گرفته در آلمان است (10). مطالعهاي كه به تازگي ) 2007) در تايلند انجام گرفته است فرااني ژنتيپه يا را بهترتي ب S2 S1 شده در شهر اصفهان است (11). مطالعات انجام گرفته حاكي از آن است كه سايتتكسين مرتبط با vac A در هليكباكترپيلري نيز همانند ساير فاكترهاي باكتريال كد شنده تسط ناحي Sab oip AIP Cag PAI بيماريزايي هليكباكترپيلري دخالت دارد (12). در مطالعهاي كه به تازگي تسط Bab Con در همكاران در كاستاريكا انجام گرفته است فرااني ژنتيپ s1b %2/75 فرااني ژنتيپ m1 نيز %2/74 گزارش شده است. در اين مطالعه همچنين رابطهي معنيداري بين ژنتيپ m1 گاستريت مشاهده شده است. در مطالعهاي ما فرااني ژنتي پ S1b m1 در گاستريت هر كدام %45 بهدست آمد كه به نسبت مطالعهي فق درصد كمتري را تشكيل م ي دهد. لي بر خلاف مطالعهي فق رابطه معنيداري بين ژنتي پ گاستريت مشاهده نشد (13). مطالع هاي كه m1 Garcia در سال 2006 در كشر شيلي انجام داده است نيز فرااني ژنتي پ هاي m1 s1a s1b s2 m2 را به ترتي ب حدد درصد نشان ميدهد. البته نمنهگيري در اين مطالعه بر اساس نع عارضهي ايجاد شده انجام نشده است. در مطالعهي ما اين مقادير بهترتي ب درصد به دست آمد. همانطر كه مشاهده ميشد در مطالعهي فق درصد قابل تجهي (%26) از نمنهها داراي ژنتيپ S2 ما اين ژنتيپ يافت نشد (14). در مطالعهاي كه Linpisarn هستند لي در مطالعهي همكاران در سال 2007 در تايلند بر ري 58 مرد گاستريت 28 مرد گاستريت السر 45 مرد دي دنال السر 4 مرد كانسر معده انجام دادند فرااني ژنتي پ %81 S1a % %0 نشان ميدهد كه مطابق با مطالعهي انجام 89 مجله دانشكده پزشكي اصفهان سال بيست هفتم / شماره 93 ا/ رديبهشت 1388

6 بررسي فرااني نسبي ژنتيپهاي مختلف vac A در... دكتر سيد اصغر هاي ي همكاران Duodenal Ulcer فرااني ژنتيپ S1a/m1 نيز %21 گزارش شده است در مطالعهي ما به نسبت S1a/m1 (15). فرااني ژنتيپ S1a پاي ني تر از اين مقدار لي فرااني ژنتي پ بسيار شبيه مرد فق (%28) ميباشد. با تجه به مطالعات ذكر شده ميتان نتيجه گرفت كه فرااني ژنتيپ S2 در اكثر مطالعات پاي ني ميباشد كه مطالعهي ما نيز تا ي ديي براي اين مضع است. m2 ساير ژنتي پ ها يعني S1a S1b m1 نيز در مناطق مختلف داراي تفاته يا قابل تجهي است كه نشان از تنع پراكندگي اين ژنتيپها دارد. مطالعهي Erzin همكاران در سال 2006 در كشر تركيه نشان ميدهد كه فرااني ژنتي پ هاي بهترتيب حدد %41 %48 ميباشد Ulcer Dyspepsia S1a S1m2 S1m1 نيز فرااني ژنتيپ در زمان كانسر معده به ترتي ب حدد 67 Chomvarin درصد ميباشد.(16) در مطالعهاي كه به تازگي تسط همكاران در تايلند انجام شده است رابطهي معنيداري بين ژنتيپه يا vac A يرلانس مثل ساير ژنهاي bab نع عارضهي cag A ice ايجاد شده در بيمار يافت نشده كه تا ييد كنندهي نتايج اين مطالعه است (11). در يك نگاه كلي ميتان دريافت كه نع ژنتيپ vac A هليكباكترپيلري رابطهاي با نع بيماري آنها ندارد. لذا در بيماران مختلف ممكن است هر كدام از ژنتيپهاي vac A در هليكباكترپيلري ايجاد كنندهي عارضه مشاهده شد. References 1. Kersulyte D, Mukhopadhyay AK, Velapatino B, Su W, Pan Z, Garcia C, et al. Differences in genotypes of Helicobacter pylori from different human populations. J Bacteriol 2000; 182(11): Mukhopadhyay AK, Kersulyte D, Jeong JY, Datta S, Ito Y, Chowdhury A, et al. Distinctiveness of genotypes of Helicobacter pylori in Calcutta, India. J Bacteriol 2000; 182(11): Maeda S, Ogura K, Yoshida H, Kanai F, Ikenoue T, Kato N, et al. Major virulence factors, VacA and CagA, are commonly positive in Helicobacter pylori isolates in Japan. Gut 1998; 42(3): Atherton JC, Cao P, Peek RM, Jr., Tummuru MK, Blaser MJ, Cover TL. Mosaicism in vacuolating cytotoxin alleles of Helicobacter pylori. Association of specific vaca types with cytotoxin production and peptic ulceration. J Biol Chem 1995; 270(30): Gunn MC, Stephens JC, Stewart JA, Rathbone BJ, West KP. The significance of caga and vaca subtypes of Helicobacter pylori in the pathogenesis of inflammation and peptic ulceration. J Clin Pathol 1998; 51(10): Fazeli A, Nafisi MR, Hazeqi K, Qavaminazhad A. Accuracy of whole- cell ELISA and HM-cap ELISA in the diagnosis of Helicobacter pylori infection. Feyz, Kashan University of Medical Sciences & Health Services 2000; 12(3): Vaira D, Malfertheiner P, Megraud F, Axon AT, Deltenre M, Hirschl AM, et al. Diagnosis of Helicobacter pylori infection with a new noninvasive antigen-based assay. HpSA European study group. Lancet 1999; 354(9172): van Doorn LJ, Figueiredo C, Sanna R, Plaisier A, Schneeberger P, de Boer W, et al. Clinical relevance of the caga, vaca, and icea status of Helicobacter pylori. Gastroenterology 1998; 115(1): Strobel S, Bereswill S, Balig P, Allgaier P, Sonntag HG, Kist M. Identification and analysis of a new vaca genotype variant of Helicobacter pylori in different patient groups in Germany. J Clin Microbiol 1998; 36(5): Han SR, Schreiber HJ, Bhakdi S, Loos M, Maeurer MJ. vaca genotypes and genetic diversity in clinical isolates of Helicobacter pylori. Clin Diagn Lab Immunol 1998; 5(2): Chomvarin C, Namwat W, Chaicumpar K, Mairiang P, Sangchan A, Sripa B, et al. Prevalence of Helicobacter pylori vaca, caga, cage, icea and baba2 genotypes in Thai dyspeptic patients. Int J Infect Dis 2008; 12(1): مجله دانشكده پزشكي اصفهان سال بيست هفتم / شماره 93 /ارديبهشت

7 بررسي فرااني نسبي ژنتيپهاي مختلف vac A در... دكتر سيد اصغر هاي ي همكاران 12. Maeda S, Mentis AF. Pathogenesis of Helicobacter pylori infection. Helicobacter 2007; 12(Suppl 1): Con SA, Takeuchi H, Valerin AL, Con-Wong R, Con-Chin GR, Con-Chin VG, et al. Diversity of Helicobacter pylori caga and vaca genes in Costa Rica: its relationship with atrophic gastritis and gastric cancer. Helicobacter 2007; 12(5): Garcia A, Barra R, Delgado C, Kawaguchi F, Trabal N, Montenegro S, et al. [Genotypying of clinical isolates of Helicobacter pylori by caga, vaca and baba2 virulence associated genes. First detection of a baba2 positive strain in Chilean patients]. Rev Med Chil 2006; 134(8): Linpisarn S, Suwan W, Lertprasertsuk N, Koosirirat C, Steger HF, Prommuangyong K, et al. Helicobacter pylori caga, vaca and icea genotypes in northern Thai patients with gastric disease. Southeast Asian J Trop Med Public Health 2007; 38(2): Erzin Y, Koksal V, Altun S, Dobrucali A, Aslan M, Erdamar S, et al. Prevalence of Helicobacter pylori vaca, caga, cage, icea, baba2 genotypes and correlation with clinical outcome in Turkish patients with dyspepsia. Helicobacter 2006; 11(6): مجله دانشكده پزشكي اصفهان سال بيست هفتم / شماره 93 /ارديبهشت 1388

8 بررسي فرااني نسبي ژنتيپهاي مختلف vac A در... دكتر سيد اصغر هاي ي همكاران Original Article Received: Accepted: Journal of Isfahan Medical School Vol 27, No 93, May 2009 Study of vac A genotypes of H.pylori Isolated from Patients with the Upper Gastrointestinal Diseases by PCR Seyed Asghar Havaei PhD *, Rasool Salehi PhD **, Seyed Ali Fazeli PhD ***, Hamid Tavakkoli MD ****, Parviz Mohajeri PhD ***** Background: Methods: Findings: Conclusion: Key words: Page count: Tables: Figures: References: Address of Correspondence: * Associate professor, Department of Microbiology, School of Medicine, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran. ** Associate professor, Department of Cell Biology, School of Medicine, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran. *** Associate professor, Deptartment of Microbiology, School of Medicine, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran. **** Assistant Professor, Department of gastroenterology, School of Medicine, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran. ***** Associate professor, Department of Microbiology, School of Medicine, Kermanshah University of Medical Sciences, Kermanshah, Iran Abstract Helicobacter pylori (H. pylori) is a gram negative curved bacilli colonized in the human stomach. It causes duodenal ulcer, gastritis and is associated with adenocarinoma. There might be a possible relationship between caga, vaca and ice a genes and clinical outcomes. The aim of this study was to identify the frequency of vaca genotypes of H. pylori isolated from the upper gastrointestinal. One hundred H. pylori strains were isolated from patients with different gastrointestinal disease who admitted to Isfahan Al-zahra hospital. Vac A alleles were typed using PCR with specific primers. There were four Vac A mosaicsms, including 28 for s1a/m1 (28%), 23 for s1b/m1 (23%), 26 for s1a/m2 (26%) and 23 for s1b/m2 (23%), s2 form was not found. The results showed there is no significant relationship between different genotypes of vaca and the related diseases. Helicobacter pylori, vac A, Adenocarinoma, Duodenal ulcer, Normal /Gastritis, PCR Seyed Asghar Havaei PhD, Associate Professor, Department of Microbiology, School of Medicine, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran. havaei@med.mui.ac.ir مجله دانشكده پزشكي اصفهان سال بيست هفتم / شماره 93 /ارديبهشت